Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Npas3Q9QZQ0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms