Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn8Q9QZ49 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms