Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ndrg3Q9QYF9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms