Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp1Q9QY53 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nphp1Q9QY53 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms