Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp3Q9QY23 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms