Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip4Q9QXN3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip4Q9QXN3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip4Q9QXN3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip4Q9QXN3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip4Q9QXN3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip4Q9QXN3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip4Q9QXN3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trip4Q9QXN3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trip4Q9QXN3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trip4Q9QXN3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip4Q9QXN3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms