Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms