Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a3Q9JKZ2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a3Q9JKZ2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms