Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms