Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nova1Q9JKN6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms