Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msgn1Q9JK54 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms