Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnga3Q9JJZ8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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