Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx20Q9JJY4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms