Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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