Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Brd4Q9ESU6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Brd4Q9ESU6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms