Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hapln2Q9ESM3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms