Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem27Q9ESG4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms