Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm7Q9ESD6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm7Q9ESD6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm7Q9ESD6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm7Q9ESD6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm7Q9ESD6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm7Q9ESD6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm7Q9ESD6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm7Q9ESD6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm7Q9ESD6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm7Q9ESD6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm7Q9ESD6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm7Q9ESD6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm7Q9ESD6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm7Q9ESD6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms