Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ush1cQ9ES64 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms