Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms