Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms