Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xab2Q9DCD2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms