Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg9Q9DB90 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smg9Q9DB90 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Smg9Q9DB90 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smg9Q9DB90 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Smg9Q9DB90 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Smg9Q9DB90 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Smg9Q9DB90 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smg9Q9DB90 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Smg9Q9DB90 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Smg9Q9DB90 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Smg9Q9DB90 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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