Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnpy3Q9DAU1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnpy3Q9DAU1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cnpy3Q9DAU1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms