Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9H8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9D9H8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D9H8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9D9H8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D9H8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Q9D9H8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q9D9H8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms