Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms