Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms