Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl4Q9D8E6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl4Q9D8E6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms