Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
U2af1Q9D883 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms