Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms