Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgm5Q9D7I9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgm5Q9D7I9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgm5Q9D7I9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm5Q9D7I9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm5Q9D7I9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms