Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Rab11fip1Q9D620 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab11fip1Q9D620 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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Rab11fip1Q9D620 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Rab11fip1Q9D620 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Rab11fip1Q9D620 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Rab11fip1Q9D620 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Rab11fip1Q9D620 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Rab11fip1Q9D620 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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