Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn11Q9D572 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms