Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Zcchc13Q9D548 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms