Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Fam227bQ9D518 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam227bQ9D518 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Fam227bQ9D518 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Fam227bQ9D518 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Fam227bQ9D518 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam227bQ9D518 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam227bQ9D518 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam227bQ9D518 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Fam227bQ9D518 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Fam227bQ9D518 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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