Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D4W2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D4W2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms