Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms