Protein–RNA interactions for Protein: Q9D476

4933407L21Rik, RIKEN cDNA 4933407L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933407L21RikQ9D476 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933407L21RikQ9D476 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933407L21RikQ9D476 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933407L21RikQ9D476 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933407L21RikQ9D476 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933407L21RikQ9D476 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933407L21RikQ9D476 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933407L21RikQ9D476 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933407L21RikQ9D476 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933407L21RikQ9D476 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933407L21RikQ9D476 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933407L21RikQ9D476 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933407L21RikQ9D476 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933407L21RikQ9D476 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933407L21RikQ9D476 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933407L21RikQ9D476 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms