Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx11Q9D3G5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx11Q9D3G5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms