Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt20Q9D312 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt20Q9D312 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms