Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms