Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms