Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms