Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elp3Q9CZX0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elp3Q9CZX0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms