Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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