Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nip7Q9CXK8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms