Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms