Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms