Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms