Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms